前面提到网站结构优化要解决的最重要的问题包括收录及页面权重分配。在理想情况下，经典树形结构应该是比较好的链接及权重分配模式。但是由于不同网站采取技术不同，要实现的功能、网站目标、重要解决的营销问题都很可能不同，某些看似是树形结构的网站，仔细研究起来其实奇形怪状。每个网站都有自己特殊的问题需要解决，没有可以适用于所有网站的结构优化秘诀，必须具体问题具体分析。
1.重点内容
  首先考虑一个最简单最常见的问题。一般来首，网站首页获得的内外部链接最多，权重最高。首页链接到一级分类页面，这些一级分类页面权重仅次于首页。大部分网站有多层分类，权重一次下降，权重最低的是最终的产品页面。
2.非必要页面
每个网站都有一些在功能及用户提样方面很必要、但在SEO角度没必要的页面，比如隐私权策略、用户登陆页面、用户注册页面。从用户角度看，这些页面时必须的功能或有助于提高网站信任度。不过搜索引擎既不能填表，也不登陆，这些页面既没有必要也不太可能获得任何排名。
 3.大二级分类
     典型树形结构首页链接到一级分类，一级分类再列出二级分类，这样，只要二级分类数目不要相差太大，权重值在二级分类页面上是大致平均分配的。不过有些时候某些二级分类下的产品数远远多一些其他小一些的二级分类，甚至产品太多的二级分类下还可能再列三级分类。平均分配权重的结果就是，小分类充分收录，产品数量大的分类有很多产品页面因为权重稀释无法收录。
  4.翻页过多
     稍大型的商务或信息类网站都可能会在产品列表。也就是最末一级的分类页面上，存在翻页过多的问题。通常产品列表会显示10个或20个产品，然后列出翻页链接，除了“上一页”和“下一页”，网站可能列出5个、10个翻页链接。用户点击页面10，第10页上又会列出10~19的翻页。
5.单一入口还是多入口
 一般来说，网站首页和分类页面收录不会有上面问题，除非主导航系统有严重蜘蛛陷阱，或者网站已经被处罚。大部分网站在结构方面面对挑战，是使更多最终产品页面被收录。就算尽量吧网站结构扁平化，当产品数量巨大时，实际上已经不太可能足够扁平。在这种情况下，要让最终产品页面被收录。有两个策略：一是多入口，而是单一入口。在选择上学哟啊谨慎。
6.相关产品链接
无论单一入口还是多入口结构，对最终产品页面来说都有一个缺陷，那就是太过规则。有时候回造成某个部分的产品页面不能被收录。单一入口的结构更明显。比如如果某个分类页面因为导航设计不合理，离首页太远没有被收录，这个分类下的所有产品就都无法被收录。再比如博客系统中，发表比较早的帖子，无论从哪个入口渠道来看，都会被推到网站更深层，离首页比较远。，老帖子虽然一般没有收录问题（早被收录了），但权重却随时间的推移而下降。
7.锚文字分布及变化
前面提到过，合理的网站结构是在网站中分配锚文字的重要方法之一。最常见灵活的是在页面正文中或人工或自动加上其他页面的内部链接，链接锚文字可以有各种选择。这方面的应用学习目标非维基百科莫属。